Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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