Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms