Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TMPOP42166 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TMPOP42166 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TMPOP42166 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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