Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD9P28356 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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