Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRDP23468 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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PTPRDP23468 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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PTPRDP23468 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRDP23468 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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