Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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