Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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