Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SMG1Q96Q15 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SMG1Q96Q15 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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