Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TRIM63Q969Q1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIM63Q969Q1 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIM63Q969Q1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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