Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms