Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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CDO1Q16878 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CDO1Q16878 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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