Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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RPE65Q16518 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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