Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC6Q16204 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC6Q16204 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CCDC6Q16204 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC6Q16204 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC6Q16204 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC6Q16204 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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