Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SNCBQ16143 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNCBQ16143 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms