Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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NEDD8Q15843 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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NEDD8Q15843 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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