Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TAF1AQ15573 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms