Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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PTPRKQ15262 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRKQ15262 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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