Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
UBE4AQ14139 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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UBE4AQ14139 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE4AQ14139 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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