Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARB2Q14108 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SCARB2Q14108 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCARB2Q14108 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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