Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SPTAN1Q13813 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SPTAN1Q13813 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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