Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ITGA9Q13797 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms