Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
KRR1Q13601 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
KRR1Q13601 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms