Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATMQ13315 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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