Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PTP4A2Q12974 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTP4A2Q12974 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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