Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GRIN2AQ12879 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GRIN2AQ12879 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms