Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
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BPTFQ12830 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
BPTFQ12830 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
BPTFQ12830 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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