Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TMPOP42166 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TMPOP42166 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
TMPOP42166 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TMPOP42166 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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