Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VPREB1P12018 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms