Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms