Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17190V9GX38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms