Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2X1

Hnrnpf, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpfQ9Z2X1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HnrnpfQ9Z2X1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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