Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Knop1Q9Z2Q2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms