Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms