Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms