Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sema4fQ9Z123 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema4fQ9Z123 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms