Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tusc2Q9WVF8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms