Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrf1Q9WU00 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms