Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp1Q9WTX5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp1Q9WTX5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms