Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col4a3Q9QZS0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms