Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms