Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ercc4Q9QZD4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ercc4Q9QZD4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms