Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mid2Q9QUS6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms