Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd2apQ9JLQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms