Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nectin3Q9JLB9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms