Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upk3aQ9JKX8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms