Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stx6Q9JKK1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stx6Q9JKK1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms