Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms