Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms