Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc22Q9JIG7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc22Q9JIG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms