Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cts6Q9ET52 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cts6Q9ET52 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms